I would simply go literal here, because you don't have an exact equivalent in the system.

"en subsidio" means "subsidiarily", i.e., first one and then the other, or, once the one has gone its way, you introduce the other type of appeal.

Below you have some articles which may shed some light on the "recurso jerárquico en subsidio". Jerárquico is the appeal addressed to the authority or superior level of hierarchy.

www.ccee.edu.uy/ensenian/catderpu/material/administrativos....
3.- Ante quien y para ante quien se interponen los recursos administrativos.-
a) El recurso de revocación debe interponerse siempre, ante el órgano que dictó el acto, sea subordinado o jerarca.-
b) Si el acto es dictado por un órgano subordinado, deben interponerse en forma conjunta y subsidiaria el recurso de revocación y el recurso jerárquico, para ante el
jerarca máximo del sistema orgánico.-
c) Si el acto es dictado por el jerarca máximo del sistema, sólo corresponde interponer
el recurso de revocación; salvo que se trate de un Servicio Descentralizado, en
que se deben interponer en forma conjunta y subsidiaria, los recursos de revocación
y de anulación (este último para ante el Poder Ejecutivo).-
4.- Cualquiera sea el órgano subordinado que dicte un acto, siempre y sólo se deben
interponer conjunta y subsidiariamente los recursos de revocación y jerárquico; éste
ultimo, para ante el jerarca máximo del sistema.-



Art.17.- Agotamiento ficto de la vía administrativa

A los ciento cincuenta días siguientes al de la interposición de los recursos de revocación ya los doscientos días siguientes a la interposición conjunta de los recursos de revocación y jerárquico, si no se hubiere dictado resolución sobre el último recurso, se tendrá por agotada la vía administrativa.

http://www.affurfm.fmed.edu.uy/Reglamentos/Ordenanza de Acto...
Vencido el plazo de ciento cincuenta días, se deberá franquear, automáticamente, el recurso jerárquico en subsidio, reputándose fictamente confirmado el acto impugnado.


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Note added at 6 hrs (2008-01-26 04:47:37 GMT)
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Checked with my University notes of my Public Law class, and below follows the EXACT description of what filing a recurso jerárquico en subsidio means. In a nutshell: you file an appeal to the administrative authority asking them to review a decision affecting you adversely, TOGETHER with a "recurso jerárquico en subsidio", i.e., appealing to the highest departmental authority. If the administrative authority finds in your favor and reverses the original decision, fine and dandy. If not, then your appeal to the highest authority [skipping all intermediate echelons] is considered to have been already filed, merely by the expiration of a prescribed time limit. If this higher authority does not issue a decision within a prescribed additional time limit, then you have completed all administrative steps and you are clear to proceed with the matter before the TCA [Contentious-Administrative Tribunal, by the acronym in Spanish. Hope that now you have a full understanding of the term.


El recurso jerárquico es el que se presenta cuando el órgano que dictó el acto está sometido a jerarquía. Y entonces, ¿ante quién, ante qué jerarquía me presento yo? Ante la máxima jerarquía. Vamos a poner otro ejemplo:

En vez de Dirección de Identificación Civil, vamos a poner el Jefe de Policía, vamos a seguir en la órbita policial. Digamos, entonces, que el Jefe de Policía de San José es el que dictó un acto, por el cual a mí, que soy agente policial en San José, me traslada a Florida. Yo encuentro esto muy inconveniente, por razones de familia, etc., y entonces, recurro el acto ante el Jefe de Policía de San José, interpongo la revocación, pero este hombre está sometido a jerarquía, y ¿quién es el jerarca que sigue? Es el Director Nacional de Policía. Si yo interpongo recurso jerárquico, entonces puedo hacerlo ante este, pero no es así, tengo que interponerlo ante la máxima jerarquía y la máxima jerarquía es el Minstro del Interior, ante quien interpondré un recurso jerárquico en subsidio. Entonces, me salteo al Director Nacional de Policía, porque el derecho lo dice así. Es lo que se conoce como regla del “omisso medio”, que dice que, si en el medio hay otras jerarquías, deberé saltearlas.

 Todos estos recursos se presentan en forma concomitante, es decir, en la misma hoja, en el mismo escrito, estoy obligado a presentarlos juntos. Cuando lo dictan al acto, yo ya sé cuáles son las jerarquías ante las cuales debo presentar el recurso jerárquico en subsidio. Así que en un mismo escrito, presento el recurso de revocación y el recurso jerárquico en subsidio.

¿Por qué “en subsidio”? Porque si la primera jerarquía, es decir, la inferior de las dos, la que dictó directamente el acto que estoy recurriendo, me diera la razón, entonces revoca el acto y dicta otro acto que resuelve en mi favor, queda agotado ahí mi recurso.

Se procede de esta forma, así lo indica el derecho, porque de esa manera yo voy a estar segura del trayecto de mi escrito; lo presento a donde se hizo el acto, pero en el escrito dejo dicho que todos los argumentos que presento a este fin, son los mismos que voy a presentar al Ministro, así que no los voy a presentar dos veces, lo que hago es encabezarlo diciendo que pido la revocación al Jefe de Policía de San José, y si este me dice que no, entonces, en subsidio, presento recurso jerárquico ante el Ministro del Interior. Si el expediente se pierde, no es mi responsabilidad. Yo me pongo a contar los días, y si vence el plazo del primero, y el plazo del segundo, ese día lo marco y al día siguiente puedo decir que se agotó la vía administrativa, y puedo recurrir ante el TCA.